تعداد نشریات | 13 |
تعداد شمارهها | 150 |
تعداد مقالات | 1,491 |
تعداد مشاهده مقاله | 2,263,938 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 1,895,998 |
تنوع ژنتیکی قارچهای اندوفیت درختچه شیرخشت (Cotoneaster integerrimus Medik.) ارسباران | ||
پژوهش و توسعه جنگل | ||
دوره 8، شماره 4، آذر 1401، صفحه 415-424 اصل مقاله (425.27 K) | ||
نوع مقاله: علمی - پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.30466/jfrd.2022.54176.1602 | ||
نویسندگان | ||
سحر سعیدی1؛ یوسف محمدی* 2؛ محمد رضا مشایخی3 | ||
1دانشآموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران | ||
2استادیار، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران | ||
3استادیار، دکترای تخصصی ژنتیک مولکولی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران | ||
چکیده | ||
قارچهای اندوفیت گیاهی نقش مهمی در فعل و انفعالات فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی گیاهان در پاسخ به شرایط محیطی ایفا میکنند. در همین راستا، شناسایی قارچهای اندوفیت گونه شیرخشت در ارسباران هدفگذاری شد. نمونههای برگ و ساقه از گیاه مذکور جداسازی و پس از ضدعفونی سطحی، در محیط کشت PDA حاوی استرپتومایسین کشت شدند. پس از رشد هیفهای قارچی و واکشت کردن آنها، از محیط کشت PDB برای ادامه کار استفاده شد. برای شناسایی ایزولههای قارچی رشدکرده، استخراج DNA و واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای نواحی فاصلهانداز رونویسیشونده داخلی (Internal Transcribed Spacer) انجام شد. نتایج حاصل از PCR، نشان داد که از 15 ایزوله جداسازی- شده، در 9 ایزوله قطعه ITS تکثیر شد. بهطوری که 3 ایزوله در گونه Penicillium sizovae، 3 ایزوله در گونه Alternaria alternate، 2 ایزوله در جنس Penicillium و ایزوله آخر بهدلیل شباهت کم توالی ITS آن با داده پایگاه، نامگذاری نشد و احتمالا گونه جدیدی باشد و نیاز به پژوهشهای تکمیلی دارد. تجزیهوتحلیل فیلوژنتیک، 4 گونه مورد نظر را در 2 کلاد کاملا متمایز قرار داد، بهطوری که کمترین فاصله ژنتیکی بین 2 گونه Penicillium و بیشترین فاصله نیز بین 2 ایزوله Penicillium sp و Fungal sp وجود دارد. این بررسی اولین گزارش در ارتباط با قارچهای اندوفیت شیرخشت بوده و نشان میدهد که این گونه گیاهی میزبان تعداد و طیف کمی از قارچهای اندوفیت است. | ||
کلیدواژهها | ||
ارسباران؛ رابطه همزیستی؛ متابولیت ثانویه؛ نواحی فاصلهانداز رونویسیشونده داخلی | ||
مراجع | ||
Arnold, A. E.; Herre, E. A., Canopy cover and leaf age affect colonization by tropical fungal endophytes: ecological pattern and process in Theobroma cacao (Malvaceae). Mycologia 2003, 95 (3), 388-398. Chauhan, N. M.; Gutama, A. D.; Aysa, A., Endophytic fungal diversity isolated from different agro-ecosystem of Enset (Ensete ventericosum) in Gedeo zone, SNNPRS, Ethiopia. BMC Microbiology 2019, 19 (1), 1-10. Clay, K.; Schardl, C., Evolutionary origins and ecological consequences of endophyte symbiosis with grasses. The American Naturalist 2002, 160 (S4), S99-S127. Deng, B. W.; Liu, K. H.; Chen, W. Q.; Ding, X. W.; Xie, X. C., Fusarium solani, Tax-3, a new endophytic taxol-producing fungus from Taxus chinensis. World Journal of Microbiology and Biotechnology 2009, 25 (1), 139-143. Ghanbari, S., Study on bio-economic aspects of reddish blackberry (Ribes biberistentii Berl. & DC) in Ilgene chay watershed of the Arasbaran forests Iran Journal of Forest Research and Development 2021, 7 (1), 45-62. (In Persian) Ghasemi Esfahlan, S.; Arzanlou, M.; Babayahri, A.; Torbati, M.; Narmani, A., Morphological and molecular characterization of endophytic fungi from oak trees in Arasbaran forests. Journal of Applied Research in Plant Protection 2019, 8 (1), 1-17. (In Persian) Ghasemi Esfahlan, S.; Arzanluou, M.; Babaei Ahari, A., Identification of endophytic Trichoderma species from oak trees in Arasbaran forests using morphological and molecular characteristics. Journal of Applied Research in Plant Protection 2017, 6 (3), 53-66. (In Persian) Hajizadeh, A.; Amini, J.; Abdollahzadeh, J., New records of endophytic fungi isolated from oak trees in Kurdistan province (Iran) Rostaniha 2015, 16 (1), 109-122. (In Persian) Janatbabaei, M.; Moradi, G.; Feghhi, J., Effect of soil and topography characteristics on distribution of plant types in the Arasbaran forests, Iran. Forest Research and Development 2019, 5 (4), 583-597. Jonbozorgi, S.; Mehrabi-Koushki, M.; Farokhinejad, R., Isolation and identification of fungal endophytes of the cowpea in Khuzestan province. Biological Journal of Microorganism 2019, 8 (29), 97-115. Kim, W.; Mauthe, W.; Hausner, G.; Klassen, G., Isolation of high molecular weight DNA and double-stranded RNAs from fungi. Canadian Journal of Botany 1990, 68 (9), 1898-1902. Larkin, M. A.; Blackshields, G.; Brown, N. P.; Chenna, R.; McGettigan, P. A.; McWilliam, H.; Valentin, F.; Wallace, I. M.; Wilm, A.; Lopez, R., Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics 2007, 23 (21), 2947-2948. Meena, H.; Hnamte, S.; Siddhardha, B., Secondary metabolites from endophytic fungi: chemical diversity and application. In Advances in Endophytic Fungal Research, Springer: 2019; pp 145-169. Nasiri Madiseh, Z.; Mofid, M.; Ebrahimi, M.; Khyam Nekouee, S.M.; Khosravi Ahahli, M., Isolation of Taxol-producing endophytes fungi from Iranian yew (Taxus baccata L.) Journal of Shahrekord Uuniversity of Medical Sciences 2010, 11 (4), 101-106. (In Persian) Patil, R. H.; Patil, M. P.; Maheshwari, V. L., Bioactive secondary metabolites from endophytic fungi: a review of biotechnological production and their potential applications. Studies in Natural Products Chemistry 2016, 49, 189-205. Roopa, G.; Madhusudhan, M.; Sunil, K.; Lisa, N.; Calvin, R.; Poornima, R.; Zeinab, N.; Kini, K.; Prakash, H.; Geetha, N., Identification of Taxol-producing endophytic fungi isolated from Salacia oblonga through genomic mining approach. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology 2015, 13 (2), 119-127. Roughanian, M.; Amini, J.; Zafari, D.; Abdollahzadeh, J., Drechslera triseptata, a new record for Iranian mycoflora. Rostaniha 2012, 13 (1), 109-110. Taechowisan, T.; Peberdy, J. F.; Lumyong, S., Isolation of endophytic actinomycetes from selected plants and their antifungal activity. World Journal of Microbiology and Biotechnology 2003, 19 (4), 381-385. Xiong, Z.-Q.; Yang, Y.-Y.; Zhao, N.; Wang, Y., Diversity of endophytic fungi and screening of fungal paclitaxel producer from Anglojap yew, Taxus x media. BMC Microbiology 2013, 13 (1), 1-10. Yang, Y.; Zhao, H.; Barrero, R. A.; Zhang, B.; Sun, G.; Wilson, I. W.; Xie, F.; Walker, K. D.; Parks, J. W.; Bruce, R., Genome sequencing and analysis of the paclitaxel-producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431. BMC Genomics 2014, 15 (1), 1-14.
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,222 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 934 |